爱华网（台湾省警备总司令部）陈仪（1945.09.01台湾行政长官兼任～1947.05.09）→（台湾全省警备总司令部）彭孟缉（1947.05.10交高雄要塞司令～1949.01.04接台湾省警备副总司令）→（台湾省警备总司令部：总司令由台湾省主席兼任）陈诚（1949.01.05～1949.08.31接东南军政长官公署长官）→（台湾省保安司令部）彭孟缉（1949.09.01交台湾省警备副总司令～1949.12.20）→吴国祯（1949.12.21～1953.04.15）→俞鸿钧（1953.04.16～1954.06.06）→严家淦（1954.06.07～1957.08.15）→周至柔（1957.08.16～1958.05.14）→（台湾警备总司令部：并台湾防卫总司令部、台湾省保安司令部、台湾省民防司令部及台北卫戌总司令部）→黄镇球（1958.05.15交台北卫戌司令～1958.08.14总统府参军长接黄杰）→黄杰（1958.08.15总统府参军长交黄镇球～1962.11.30台湾省政府主席接周至柔）→陈大庆（1962.12.01国家安全局长交夏季屏～1964.07.01改制台湾警备总司令兼军管区司令～1967.06.30陆军总司令接高魁元）→刘玉章（1967.07.01交警备副总司令～1970.06.30）→尹俊（1970.07.01交陆军副总司令～1975.04.06）→郑为元（1975.04.07联合勤务总司令交罗友伦～1978.05.31国防部副部长接冯启聪）→汪敬煦（1978.06.01交情报局局长～1981.11.30国家安全局长接王永树）→陈守山（1981.12.01交陆军副总司令～1989.12.04国防部副部长接郭宗清）→周仲南（1989.12.05宪兵司令交王若愚～1992.07.31）→（台湾军管区司令部兼海岸巡防司令部）→王若愚（1992.08.01宪兵司令交曹文生～1992.11.01改制军管区司令兼海岸巡防司令～1996.06.30）→李建中（1996.07.01副参谋总长交杨德智～1998.01.31）→陈镇湘（1998.02.01金门防卫司令交朱凯生～1999.01.31陆军总司令接汤曜明）→金恩庆（1999.02.01交陆军副总司令～2000.02.01改制军管区司令～2002.02.25）→陈邦治（2002.02.26交军管区副司令～2002.03.01改制后备司令～2003.01.31总政战局长接邓祖琳）→谢建东（2003.02.01联合后勤司令交高华柱～2003.08.31国防大学校长接陈镇湘）→薛石民（2003.09.01军事情报局长交戴伯特～2004.03.31国家安全局长接蔡朝明）→陈体端（2004.04.01交常务次长～2005.05.31）→余连发（2005.06.01军事情报局长交彭胜竹～2008.05.31）→副司令李铭藤中将代理（2008.06.01～2008.09.30）→降中将缺→陈良浚（2008.10.01八军团指挥官交严德发～2011.04.30）→ 邱国正（2011.05.01六军团指挥官交朱玉书～2012.08.31国防大学校长接陈永康）→副司令毕学文代（2012.09.01～）
副总司令、副司令：
罗张（1982.09.01海军陆战队司令交屠由信～1984.06.30接警政署长）、屠由信（1985.03.01海军陆战队司令交黄端先～）、陈连生（～1985.05.02～）、刘戈伦（～1987.10）、杨亭云（1987总政战部副主任兼执行官交武士嵩～1988.01.31总政战部副主任兼执行官接武士嵩）、周世斌（1987.05.01交中央警官学校校长～1990.02.28接退除役官兵辅导委员会秘书长）、孙森（1988.02.01交总政战部副主任～）、李屏（）、张墨林（1990.05.01警备总司令部参谋长交陈镇湘）、黄家瑾（1991.07.01交总政战部副主任）、汤元普（1992.02.16战争学院院长交徐博生～1994.04.16～）、马履绥（1992.07.01陆战队司令交郑国南～1993.07.31接国安局副局长）、陈镇湘（1993.10.16军管部参谋长交吴其梁～1994.02.28十军团司令接郭达沾）、韦正哲（交督察部督考试主任～1995.03.28～1995.04.11～）、吴其梁（1995.04.01军管部参谋长交汤先智～1999.02.15）、郑国南 (1996.01.01陆战队司令交高王珏～1997.11.30）、尹立人（1996.02.01交二局局长～）、罗吉源（1995.09.01交陆军总司令部战计会主委～1996.06.30）、周正之（1998.01.01陆军后勤司令交谢抗建～1998.10.31）、高王珏（1998.06.01陆战队司令交陈邦治～）、杨世虎（1999.12.30～2000.01.04）、毕丹（1999.02.01陆军总司令部督察长交龚以敏～2000.01.31接海巡署常务副署长）、龚以敏（（1999.10.21陆军总司令部督察长）～交陆军总司令部督察长～2000.12.14）、汤先智（2000.01.14交军管部参谋长～2000.10.15）、陈邦治（2000.09.01陆战队司令交季麟连～2002.02.28后备司令接金恩庆）、周康生（2002.03.01人力司长交吴达澎～2003.06.30）、林国栋（2003.07.01后备司令部参谋长交袁肖龙～2005.06.30）、陆华宁（2004.06.21马祖防卫司令交程士瑜～2004.12.31）、王根林（2004.04.01人事次长裁编～2004.05.31人事次长复编）、袁肖龙（2005.07.01后备司令部参谋长交李铭藤～2008.06.30）、张戡平（2006.11.01交北部地区后备指挥官～2007.11.30特勤中心副指挥官接许立孟）、李铭藤（～2008.01.31交司令部参谋长～2008.06.01～2008.09.30代理司令～2010.09.30）、何雍坚（2009.06.01宪兵司令交李翔宙～2009.12.04收押）、傅永茂（2010.10.01澎湖防卫指挥官交何安继～2011.01.31国防大学副校长接王春江）、毕学文（2011.08.01后备事务司长交阎仁义～）
参谋长：
张墨林（～1990.04.30接副总司令）→陈镇湘（1990.05.01空特司令交邓祖琳～1993.10.15接军管副司令）→吴其梁（1993.10.16成功岭班主任交宋恩临～1995.03.31接军管副司令）→汤先智（1995.04.01交军管部战计会主委～1997.06.17）→叶克新（（1998.06.02台北师管区司令）～2000.01.31接海岸巡防总局总局长）→林国栋（2000.02.01交台北师管区司令～2002.03.01改制后备司令部参谋长～2003.06.30）→袁肖龙（2003.07.01北部地区后备司令交张戡平～2005.06.30接后备副司令）→李铭藤（2005.07.01交后备司令部督察长～2008.01.17～接后备副司令）→毕学文（2008.03.25南部地区后备指挥官交李海同～2010.01.15后备事务司长接张庆翔）→林芳旋（司令部督察长交徐文飞～2010.07.09～2011.02.01代副司令～2011.06.30）→陈嘉尚（2011.07.01南部地区后备指挥官交杨驾人～2011.12.28～）
副参谋长（少将缺）：
关关豹（～2003.08.05～2004.01.31南部地区后备司令接臧幼侠）、林进（～2005.03.09～2005.05.04～）、毕学文（～2005.08.02～2005.11.30南部地区后备司令接关关豹）、林芳旋（～2006.04.20～2006.10.31北部地区后备指挥部指挥官接张戡平）、徐材霖（～2006.11.23～2008.12.25～）、吕博中（～2006.12.02～2008.08.07～）、丘志中（～2008.08.07～2009.02.26～）、梁文正（～2009.01.27～2010.01.12～）、朱富圆（～2010.07.12～2010.10.31中部地区后备指挥官接尹志浩）、李世国（～2011.01.23～2011.06.30中部地区后备指挥官接朱富圆）、杨驾人（～2011.01.28～2011.06.30南部地区后备指挥官接陈嘉尚）、朱富圆（2011.07.01中部地区后备指挥官交李世国～2012.01.19～）
督察长：
翁弘彦（～2004.01.29～）→李铭藤（～2004.09.17～2005.06.30司令部参谋长接袁肖龙）→关关豹（2005.12.01～2006.07.19～）→贺忠文（～2007.08.01～2007.11.22～）→尹志浩（2008.06.01战备训练处长交梁文正～2009.07.02中部地区后备指挥官接徐文飞）→林芳旋（2009.07.03北部地区后备指挥官交徐文飞～2010.03.05～）→徐文飞（2010.04.01北部地区后备指挥官交杨文镇～2010.09.30）→尹志浩（2010.11.01中部地区后备指挥官交朱富圆～2010.11.20代理北部地区后备指挥官～2011.07.01代副司令～2011.07.31停止代理～2012.03.22～）
北警部司令：
马有敬（～1992.02.15接警政会主委）→傅丙仁（1992.02.16交南警部副司令～1994.12.25）→商景全（～1996.07.19～1997.03.24～）→叶克新（交台南师管区司令～1998.06.02～军管部参谋长接汤先智）→林国栋（1998.09.15～2000.01.31军管部参谋长接叶克新）→袁肖龙（2000.02.01～2002.03.01改制北部地区后备司令～2003.06.30后备司令部参谋长接林国栋）→张戡平（2003.07.01交玉山警卫室参谋主任～2006.03.01改制北部地区后备指挥部～2006.10.31接后备副司令）→降少将缺→林芳旋（2006.11.01交司令部副参谋长～2009.07.02接司令部督察长）→徐文飞（2009.07.03交中部地区后备指挥官～2010.03.31接司令部督察长）→杨文镇（2010.04.01～2010.11.19督察长尹志浩代理～2010.12.03杨文镇续～2012.06.10～）
中警部司令：
詹翰英（～1991.02陈履安部长办公室主任接马登鹤）→汤先智（1991.02宪兵副司令交沈富生～接军管部战计会主委）→刘元周（～1994.10.23～1996.06.23～）→冯滇生（～1996.10～1997.12.24生中将～）→芮明福（交台中师管部副司令～1999.09.16～1999.12.22～）→降少将缺→李铭藤（～2000.08.01～2002.03.01改制中部地区后备司令～2004.07.05～接司令部督察长）→贺忠文（交南部地区后备副司令～2004.09.14～2006.03.01改制中部地区后备指挥官～2006.08.31）→何复明（2006.09.01交北部地区后备副指挥官～2008.05.31）→徐文飞（2008.06.01交中部地区后备副指挥官～2009.06.30北部地区后备指挥官接林芳旋）→尹志浩（2009.07.03司令部督察长交林芳旋～2010.10.31接司令部督察长）→朱富圆（2010.11.01交司令部副参谋长～2011.06.30接司令部副参谋长）→李世国（2011.07.01交司令部副参谋长～2012.07.01～）
南警部司令：
康景文→薄荣萍（交军管部副参谋长～1994.01.01升中将～1996.06接军管部战计会主委）→叶克新（1996.06交后备动员学校校长～1997.12.24升中将～接台北师管部司令（1998.06.02））→降少将缺→臧幼侠（～2000.06.02～2002.03.01改制南部地区后备司令～2004.01.31）→关关豹（2004.02.01交司令部副参谋长～2005.11.30司令部督察长接李铭藤）→毕学文（2005.12.01交司令部副参谋长～2006.03.01改制南部地区后备指挥官～2008.03.24司令部参谋长接李铭藤）→李海同（2008.03.25中部地区后备副指挥官交徐文飞～2009.06.30）→副指挥官陈之望代理（2009.07.01～2009.11.05）→陈嘉尚（2009.11.06交司令部战备训练处长～2011.06.30司令部参谋长接林芳旋）→杨驾人（2011.07.01交司令部副参谋长～2012.007.01～）
东警部司令：
张伟→金恩庆（～1992.02.15马防部司令接颜忠诚）→杨世虎（1992.02.16～1994.03.20）→刘大鹏（1994.07.19～1997.02.22）→卫元胜（～1998.01.17～1999.01.01～）→降少将缺
海岸巡防总局长
叶克新（2000.02.01交军管部参谋长～2004.11.30）→贺湘台（2004.12.01交海岸巡防署情报处长～2010.07.15）→通电信息处处长萧文彬代理（文职：2010.07.16～2010.07.30）→杨新义（2010.08.01交中部地区巡防局局长～）
海岸巡防总局副总局长：
林肇成（～2002.01.23～）
北部地区巡防局长：
芮明福（2000.02.17～2001.04.30接中部地区巡防局长）→王文镇（2001.05.01交南部地区巡防局长～2002.01.31）→降为少将缺→杨丽川（2004.12.01交海巡署巡防处长～2005.12.15～）
中部地区巡防局长：
贺湘台（少将：2000.02.17～2001.04.30接南部地区巡防局长）→芮明福（2001.05.01交北部地区巡防局长～2002.06.27～）→降为少将缺
南部地区巡防局长：
王文镇（2000.02.17～2001.04.30接北部地区巡防局长）→贺湘台（少将：2001.05.01交中部地区巡防局长～2002.12.19）→降为少将缺→杨丽川（～2008.02.02～）
东部地区巡防局长：
少将缺
－－－－少将－－－－
北部地区后备指挥部副指挥官：
徐材霖（～2003.09.19～2005.03.22～）→何复明（）→王黎升（～2007.09.22～2008.05.22～）→邵光奕（～2008.06.16～2008.08.12～）
中部地区后备指挥部副指挥官：
林文彬（～2001.06.18～2002.06.12～）→何复明（～2003.05.09～2005.01.11～）→2006.03.01改制中部地区后备副指挥官→李海同（～2006.04.17～2008.03.24南部地区后备指挥官接毕学文）→徐文飞（～2008.04.28～2008.06.30中部地区后备指挥官接何复明）→王黎升（～2008.07.07～2008.08.14接司令部动员管理处处长）→吕博中（～2008.09.04～2008.10.30～）
南部地区后备指挥部副指挥官：
贺忠文（～2002.01.10～2004.05.18～）→李海同（2004.08.01高雄市后备司令交徐文飞～2005.01.25～）→徐材霖（～2005.07.16～2006.03.01改制南部地区后备副指挥官～2006.10.26～）→王少谷（～2007.01.01～2008.10.18～）
台北市后备指挥部指挥官：
关关豹（～1999.06.06～1999.08.23～）→何复明（～2000.09.30～2002.12.14～）→周南强（～2003.05.14～2005.04.16～）→邵光奕（～2008.01.05～2008.05.27～）
高雄市后备指挥部指挥官：
高雄市团管部司令：张德浩（～1999.08.09～）→贺忠文（～2000.10.14～）→李海同（～2001.11.07～2002.03.01改制高雄市后备司令～2004.07.31南部地区后备副指挥官接贺忠文）→徐文飞（2004.08.01～2008.03.25～）
战备训练处长：
作战计划处长毕学文（～2004.03.30～2004.05.25～）→战备训练处长尹志浩（～2007.01.02～2008.05.31接司令部督察长）→梁文正（2008.06.01～2008.12.25～）→陈嘉尚（～2009.06.26～2009.10.31南部地区后备指挥官接李海同）→杨驾人（～2009.12.04～2010.09.28～接司令部副参谋长））→曾令群（～2011.07.22～2012.01.20）
动员管理处长：
林文彬（～1999.09.28～）→徐材霖（～2001.07.18～2003.01.16～）→林芳旋（～2003.10.13～2005.07.05～）→丘志中（～2006.12.05～2008.05.26～接司令部副参谋长）→王黎升（2008.08.14交中区指挥部副指挥官～2008.11.06～）→翁清龙（～2008.12.18～2009.06.13～）→李世国（～2009.12.30～2010.05.06～接司令部副参谋长）→邱国梁（～2011.07.01～2012.02.23～）
作战情报处长：
徐克民（～2000.10.31～）
后备动员管理学校校长：
段国基（～2002.08.16～）→
