PDB搜索技巧小结Drugbank,BindingDatebase,Google drugbank 文本挖掘

1. 在使用RCSBPDB搜索时,会遇到无此蛋白情况~其————情况可能是此蛋白有别的名称,如Amiloride-sensitive sodium channelα-subunit,在PDB中就无法搜到相应数据,此时可以利用Drugbank,BindingDatebase,Google,EMBL,Uniport,ZINC等数据库或搜索引擎进行检索。

1.1 以此蛋白(Amiloride-sensitive sodium channelα-subunit)为例,在google和Uniport上能检索到相关信息,Uniport显示此蛋白的名称有Recommendedname:
Amiloride-sensitive sodium channel subunitalpha

Alternativename(s):
PDB搜索技巧小结(Drugbank,BindingDatebase,Google) drugbank 文本挖掘
Alpha-NaCH
Epithelial Na(+) channel subunit alpha
Shortname=Alpha-ENaC
Nonvoltage-gated sodium channel 1 subunit alpha
SCNEA而通过google搜索到的信息更多了,通过谷歌检索到Drugbank数据库,而Drugbank显示此蛋白的Synonyms名称有:有了这些名字再在PDB中检索出来的几率就会大大增加。 1.2此外Wikipedia是一个很强大的工具,可直接对蛋白质名称进行检索,如果有此蛋白数据的话在页面的左方就会显示出此蛋白在各种数据库中的链接,其中就可能包括指向PDB数据库的。 1.3通过Ligand的进行逆向检索也不失为一种方法。2. 若要进行模拟或进行CADD,则resolution最好低于2.00Å;最好是Co结构,即complex

  

爱华网本文地址 » http://www.aihuau.com/a/25101016/291835.html

更多阅读

谷歌搜索高级语法技巧大全 谷歌高级搜索语法

谷歌搜索高级语法技巧大全——简介Google是全球最大的搜索引擎公司,每天处理数以亿计的搜索请求。灵活运用google搜索技巧可以帮助我们更快速更准确的在浩瀚的互联网中找到需要的信息。谷歌搜索高级语法技巧大全——方法/步骤谷歌搜

Google谷歌搜索无法访问怎么办 精 访问google搜索

Google谷歌搜索无法访问怎么办 精——简介Google搜索不能使用怎么办?目前国内贵谷歌搜索进行了限制,所以会出现谷歌搜索无法访问的情况,遇到这样的情况你可以使用多种方式来解决无法访问谷歌搜索的问题,下面小编为您支招,轻松访问谷歌搜

电驴的搜索方法使用技巧 电驴搜索技巧

电驴的搜索方法(原创)电驴edonkey有搜索的功能,如果灵活运用可以找到不少好片子:初级:使用和sm有关的关键词:??如:bdsm,bondage,rape,outdoor,handcuff,slave,scat(屎尿),enema(灌肠),semen(精液),japan,gay等....? ?可以用两个词组和进行

百度搜索技巧珍藏版 百度搜索引擎技巧

大家虽然总是用baidu,但是baidu出来的东西有很多是我们不想要的。实际上,baidu的搜索是由很多技巧的你知道吗?来!看看吧!1.减除无关资料。有时候,排除含有某些词语的资料有利于缩小查询范围。百度支持“—功能”,用于有目的地删除某些无关

声明:《PDB搜索技巧小结Drugbank,BindingDatebase,Google drugbank 文本挖掘》为网友暗香疏影分享!如侵犯到您的合法权益请联系我们删除