爱华网藤博喜欢打猎，光太郎虽然与他算是朋友，但彼此间也因此有些隔阂。几天过去了，光太郎一直在帮助寻找由子的下落。一天光太郎无意间找到了袋鼠怪兽潘多拉的家，光正要开枪突然由子出现在他的面前阻止了他。光太郎这才明白了事实的真相——袋鼠不仅救了由子还治好的她的伤。由于由子的伤口还未完全愈合所以暂时和潘多拉生活在一起。
藤博找了两个人手带着上膛的猎枪上山了。潘多拉在进食的时候被藤博发现了行踪，遭到了一阵猛烈的枪击负伤逃回了岩洞。光太郎和由子为潘多拉治疗枪伤，而善良的由子为了报答潘多拉的救命之恩决定留下来照顾它。藤博知道了这件事怒不可揭不顾光太郎的再三劝阻执意要上山杀怪兽，他甚至对光太郎以枪相向，他的这一举动让光太郎感到十分震惊和失望。随后藤博命令那两个人把光太郎捆绑在树上，带着枪继续寻找怪兽去了。
藤博三人用卑劣的手段陷害潘多拉的孩子奇贝，并把巨大的岩石推下山谷压住了潘多拉的尾巴。为了报复，藤博当着潘多拉的面射杀了奇贝。眼睁睁地看着自己的孩子死去，痛苦得近乎疯狂的潘多拉使出全身的力气翻开巨石，开始了对人类的报复。
光太郎机智地用插在靴子里的匕首割断绳索，暂时用烟幕弹拖延潘多拉的进攻救出了藤博和由子，ZAT队立即出动了。但是潘多拉喷出的火焰使ZAT队几乎无法靠近，进攻也不怎么起作用，潘多拉仍然步步逼近藤博，就在这时，泰罗出现了。潘多拉强有力的尾巴使泰罗吃了不少苦头，但泰罗并没有多少反击。或许是精神和肉体饱收摧残，被摔在地上的潘多拉又看见了自己死去的孩子，痛苦地闭上了双眼……由子恳求泰罗不要杀死善良的潘多拉，泰罗用复原光线赋予了奇贝第二次生命，潘多拉也在光线下苏醒，经历了生死离别的母子终于又重逢了！泰罗让它们返回地底世界，再也不要回到人类世界上来了。
由子和藤博又生活在一起了。广阔的湖面上他们开着快艇在兜风，藤博对由子许诺从此以后再也不打猎了。——“人类的错误就是用枪去射杀无辜的动物，我终于明白了。”
随着猎枪沉入湖底，一切又恢复了平静。ZAT队和光太郎望着烟波浩渺的湖面，欣慰地笑了……
