尿道结石分为原发性和继发性两类，其病因如下：
1.原发性尿道结石 指开始就在尿道内生成的结石，尿道狭窄、感染、潴留性囊肿、黏膜损伤、憩室及异物等为其病因。
2.继发性尿道结石 指结石先在尿道上方的泌尿系统中形成后排入尿道并停留在尿道内，多停留在尿道生理膨大部位及狭窄部的近侧，故尿道结石多见于尿道前列腺部、球部、阴茎部、舟状窝及尿道外口处。
尿道结石多数来源于膀胱和上尿路，并停留于前列腺尿道、尿道球部、阴茎部、舟状窝或尿道外口处。所以其成分与膀胱结石或上尿路结石的成分一致。如果结石与感染有关，原发尿道结石多为感染结石，通常为多发。结石也可以原发于尿道狭窄近端或者尿道憩室中。
尿道结石除了原发病的损害外，还可以引起尿道梗阻，结石对局部黏膜的长期机械刺激引起黏膜损伤，发生炎症、溃疡、增生、感染、脓肿等，少数甚至引起尿瘘等严重并发症。
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