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1990年第4届主题：使全国免疫接种率达到85%以上
1991年第5届主题：儿童的权利与机会——免疫、消灭脊髓灰质炎
1992年第6届主题：消灭脊髓灰质炎，开展乙型肝炎疫苗接种，保护儿童健康
1993年第7届主题：社会参与——消灭脊髓灰质炎
1994年第8届主题：1995年——全国消灭脊髓灰质炎
1995年第9届主题：无脊髓灰质炎世界
1996年第10届主题：普及儿童免疫，向孩子们献出一片爱心
1997年第11届主题：让每一个未免疫的儿童得到免疫
1998年第12届主题：免疫——孩子健康与家庭幸福
1999年第13届主题：乙肝——健康的大敌，疫苗——预防的武器
2000年第14届主题：免疫——关注流动人口中的儿童
2001年第15届主题：保持无脊髓灰质炎状态
2002年第16届主题：为了孩子健康注射乙肝疫苗
2003年第17届主题：乙肝疫苗--献给新生命的爱
2011年第18届主题：免疫接种，预防乙肝
2005年第19届主题：实施免疫规划，保护儿童健康
2006年第20届主题： 同样的权利，同样的健康—关注流动儿童预防接种
2007年第21届主题： 让每个儿童都能按时接种疫苗是各级政府的责任
2008年第22届主题： 预防接种，健康的保障
2009年第23届主题： 及时接种疫苗，人人享有健康
2010年第24届主题： 消除麻疹，控制乙肝，你我共参与
2011年第25届主题：接种疫苗 宝宝健康
2012年第26届主题：接种疫苗，家庭有责
2013年第27届主题：宝宝健康，从接种疫苗开始
2014年第28届主题：接种疫苗，保障健康
2015年第29届主题：预防接种——孩子的权利 社会的责任
