明星分子 明星分子?!直接在图里找咯!

明星分子 明星分子?!直接在图里找咯!

我叫林平之,是莫愁师姐的师弟,也是万年NPC。嗯,今天要讲的是文献里的一件事情,因为,我经常能在文献里看到这样的图:

为啥要做这样的蛋白呢?凭什么做这俩蛋白呢?明星分子?为啥这俩才算是明星分子呢?


莫愁:呃,其实吧,之前我给你讲过一个原理,叫做六度空间原理。(不知道的点这里)1967年,美国心理学家米尔格兰姆设计了一个连锁信件实验,他把一些信交给随机的美国市民,然后让他们通过朋友把信交还给他,这封信最多就转了六次手。所以他提出了这样的理论,也就是世界上两个不相关的人之间,最多隔了六个人。

蛋白之间的相互关系其实也是类似的,虽然看似不相关的两个蛋白,其实通过信号通路可能就变得相关起来。但有一点在六度空间理论里没有明确,就是其实最后拿到大多数信并交还给心理学家的,都是他的一个股票经纪人。因为这个股票经纪人人脉非常广,几乎所有人都认识他。


也就是说,在整个人际网络中有个把人掌握了最大的相关性资源:

如果我们需要图上左上角的人和右下角那个人联络的话,就需要这样:

但是如果失去这两个掌握较多人脉的关键角色后,左上角那个人要联络到右下角那位,就需要这样了:

所以,掌握关键节点最多的那个,在基因层面,就被称为明星分子。


大家都知道,传统的信号通路都是这样的,不知道的话,如果你买了《实验万事屋》,请翻到第69页,这样的话你就能了解,所有信号通路大概都是类似这样:

这样看的话,其实第二信使掌握着信号传递的关键,比如MAPK信号通路里的Ras和Erk:

但其实很多时候,信号通路复杂起来,会是这样的:

所以,一般的文献里,会选取那些有跟多关键节点的基因,作为明星分子,在文章里进行验证。毕竟牵一发可以动全剧,就像是AKT和PIK3CA这样:

现在你明白为什么文章里会选取明星分子了吧。





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