爱华网神话时代起，每当邪恶出现，正义的希望战士・圣斗士必然会挺身而出。他们身穿与星座对应的圣衣，为女神雅典娜而战。本作剧情是由原作者车田正美授权东映完成制作的官方续作，可以说是圣斗士系列的延续，从2012年4月1日开始每周日上午6:30-7:00在朝日电视台播放。圣斗士星矢Ω以新一代圣斗士的战斗故事为主线，讲述天马座青铜圣斗士光牙和同伴们不畏艰险，共同对抗企图挟持女神雅典娜、毁灭世界的邪恶势力玛尔斯的故事。前一代的天马座青铜圣斗士星矢则以“传说中的黄金圣斗士”身份登场。
小马座_圣斗士星矢Ω角色列表 -雅典娜军
女神・雅典娜
城户纱织（Kido Saori）声优：中川翔子
初登场：01话
女神雅典娜的化身。
身上被玛尔斯留下魔伤，其影响逐渐侵蚀着她的身体。由辰巳和萨尔娜陪伴在孤岛上疗养，并养育被星矢所救的少年光牙长大。对光牙隐瞒了自己是雅典娜一事，对朦胧存在于光牙记忆中的星矢也只字未提。对光牙来说既是养育他的亲人，又是他所憧憬的人。
性格充满慈爱和温柔。
故事开始时和玛尔斯再度对峙，被玛尔斯抓走一直囚禁在火星。在Palaestra里流传着与事实不符的消息，就算是“沙织”这个名字也有学生不知道。
在击败玛尔斯之后，面临着自己的妹妹帕拉斯的挑战，集结全体圣斗士，与帕拉斯正式开战。
在哈宾杰和星矢的陪伴下已经到达帕拉斯所在之地，在一番激战后终于说服帕拉斯，然而却被欧罗巴趁机夺走了大量小宇宙。
阿莉娅
阿莉娅（アリア，Aria）
声优：能登麻美子（日）、魏晶琦（台湾）
年龄：13岁
拥有强大的光属性小宇宙的少女，能够和光牙的小宇宙产生共鸣。
被伊奥尼亚和玛尔斯胁迫成为雅典娜的替身。通过她的力量，玛尔斯军占领了Palaestra和圣域。
与光牙同为玛尔斯初次袭击圣域时遗失在战场上的孤儿，和光牙可能是亲生兄妹。在黑暗遗迹中，得知与光牙分别为光之子和暗之子，在玛尔斯降临黑暗遗迹后作为新的雅典娜而觉醒，并且有了自己的权杖。之后与玛尔斯对抗，被后者杀死。在与幕后黑手阿普斯的决战中，权杖被粉碎，但是成功唤醒了一直被封印的星矢。在决战的最后，残余的光之小宇宙支援光牙挡下阿普斯的攻击、消灭了阿普斯。玛尔斯之战结束后被伊甸安葬。
传说中的圣斗士
射手座星矢（せいや，Seiya）
声优：古谷彻（日 ）、魏伯勤（台湾）
初登场：01话
必杀技：天马流星拳（Pegasus Ryuseiken）、天马彗星拳（Pegesus Suiseiken）、天马回旋碎击拳（Pegasus Rolling Crush）、原子闪电光速拳（Atomic Thunder Bolt）、黄金箭（Golden Arrow)、宇宙星矢（Cosmic Star Arrow）
前作《圣斗士星矢》主人公，曾数次挽救过大地危机的“传说中的圣斗士”，前任天马座，雅典娜身边最强最忠诚的战士。在本系列中作为射手座（人马座）黄金圣斗士登场。拥有十分强大的小宇宙，灵魂状态能从玛尔斯手中救出光牙，全身布满黑暗之伤亦能在最后关头将阿普斯的灵魂击出光牙的身体，为本作的灵魂人物。
第二季开始后参加了雅典娜与女神帕拉斯之间的战争。
91话见证了两位女神的战斗，并觉醒了神血新生射手座圣衣，与身披创世刻衣的泰坦开战。
92话与泰坦激战，表明了自己守护“城户沙织”这位女性的决心。激战过后见证了雅典娜与帕拉斯两位女神重归于好。后因欧罗巴利用螺旋环吸收了雅典娜和帕拉斯的小宇宙，和泰坦一起攻击欧罗巴，被轻易挡下。现带领光牙等六人前往土星，与萨图恩作最后的决战。
天秤座紫龙（しりゅ，Shiryu）
声优：成田剑
登场：19话
必杀技：庐山升龙霸（Rozan Shoryuha）、庐山龙飞翔（Rozan Ryuhisho）、庐山百龙霸（Rozan Hyakuryuha）、庐山亢龙霸（Rozan Koryuha）、圣剑（Excalibur）
龙峰的父亲兼师父，玄武的师兄。原天龙座的青铜圣斗士，星矢当年的战友之一，经历了无数次的死斗，是雅典娜最忠实的战士之一。在十二年前与玛尔斯的战斗中身受魔伤，五感全失，只能静坐在庐山五老峰瀑布前以小宇宙教导龙峰。
77话正式与雅典娜等人汇合，接手了天秤座的圣衣。
83话打倒了二级刻斗士中最强的瑞亚。
87话与贵鬼，不动一起对决许珀里翁，在无法战胜对方的情况下三人合力使出雅典娜之惊叹，小宇宙爆炸的光芒将三人吞没，生死不明。
白鸟座/天鹅座冰河（ひょうが，Hyoga）
声优：宫野真守（日）、刘杰（台湾）
登场：21话
必杀技：钻石星尘拳（Diamond Dust）、冰之环（Ring of Ice）、寒冰龙卷风（Kholodnyi Smerch）、极光雷鸣冲击/金光火焰旋风拳（Aurora Thunder Attack）、极光处刑/曙光女神之宽恕（Aurora Execution）、冰之柩（Freezing Coffin）、冻结拳
传说中的圣斗士，经历过无数次死斗，是雅典娜最忠实的战士之一，是前任水瓶座圣斗士卡妙的弟子。在与玛尔斯之战中身负魔伤而一度隐居。第一季中以“谜之男”的身份激励光牙重新振作。
80话冰封时贞，现在正和瞬，哈兵杰，泰坦一起对峙米拉与欧罗巴。
仙女座瞬（しゅん， Shun）
声优：神谷浩史、魏晶琦（台湾）
登场：12话
必杀技：星云锁链（Nebula Chain）、雷鸣波浪（Thunder Wave）、星云气流（Nebula Stream）、星云风暴（Nebula Storm）、仙女座星云（Andromeda nebula）、回旋防御（Rolling Defense）、环状防御（Cycle Defense）
传说中的圣斗士，经历过无数次死斗，是雅典娜最忠实的战士之一。在与玛尔斯之战中身负魔伤而一度隐居。在一个阿拉伯语系的村庄中开了间诊所，周游贫苦村庄替村民治病。性格温和善良，即使是敌人也不愿置其于死地。
79话击败苏鲁特。现与冰河，哈兵杰，泰坦一起对决米拉与欧罗巴。
凤凰座一辉（いっき，Ikki）
声优：杉田智和
登场：76话
必杀技：凤翼天翔（Hou Yoku Ten Sho）、凤凰幻魔拳（Phoenix Genma Ken）
传说中的圣斗士，经历过无数次死斗，是雅典娜最忠实的战士之一。瞬的同胞兄长，但是与瞬相反，拥有强硬的性格，对敌人绝不留情。有着【无论倒下几次都会再度站起来，并且比之前更加强大】的不死鸟的特征。在光牙等人与玛尔斯战斗的期间，一直在调查帕拉斯背后的黑手。期间与埃该翁战斗，在重爆雷斩刃上留下伤痕，但自己也身受重伤。
76话初次登场打倒了米拉（两人都未尽全力）。
82话打断埃该翁的圣剑并和他同归于尽，目前生死不明。
青铜圣斗士
天马座光牙（こうが，Kouga）
声优：绿川光/雪野五月（日）、何志威（台湾）
登场：01话
必杀技：天马闪光拳、天马流星拳、天马彗星拳、天马回旋碎击拳
国籍：日本
年龄：13岁、
属性：光。暗两属性
本作主人公。从婴儿时代开始就被司掌地球的女神雅典娜（城户纱织）养育长大。在六位主角中最后一个觉醒第七感。
因在十三年前承受了阿普斯的暗之小宇宙而成为其复活的容器，第一季结局时在大家的帮助下摆脱黑暗，并集合众人的小宇宙打败了阿普斯。
86话领悟到了Ω的门槛，在同伴的协助下以天马回旋碎击拳击杀高卢。
88话被许珀里翁以压倒性的实力击倒，圣衣被粉碎，但他和伙伴们决不放弃的信念使他们觉醒了真正的Ω，圣衣重生并进化为Ω圣衣。和同伴一起重创了许珀里翁。
92话末尾与众人一同见证见证昴的异变。现在星矢的带领下与伙伴们一起前往土星，与萨图恩作最后决战。
小马座昴（すばる，Subaru）
声优：水岛裕
登场：52话
必杀技：昴宿星团冲击、超新星爆裂、昴宿星团暴风雨
年龄：12岁
小马座青铜圣斗士，自称“想要成为神的男人”。原本是前幼狮座蛮与前天狼座那智训练的钢铁圣斗士，加入钢铁圣斗士前没有过去的任何记忆。在得知光牙的事情后离开训练营与光牙对决，落败后成为光牙的同伴。身上隐藏着神秘且强大无比的未知力量，昴已经随着光牙等人还有其他钢铁圣斗士们一起攻入了帕拉斯要塞，并在72话获得了小马座的圣衣，成为青铜圣斗士。
88话虽然曾经一度爆发了神秘的小宇宙压制了许珀里翁，但随后就被许珀里翁以时光毁灭斩断了时间，89话中在自己的精神世界里和一位神秘存在交谈关于人类的话题，并重新获得自由，将想自爆的许珀里翁打飞上天，解救了同伴。
92话末尾觉醒回真实身份――时刻之神・萨图恩，成为最终boss。小马座圣衣被膨胀的神之小宇宙粉碎。
幼狮座苍摩（そうま，Soma）
声优：小西克幸（日）、李景唐（台湾）
登场：02话
必杀技：烈焰暴徒/爆
